臭氧是国际公认的环保型绿色杀菌剂，不会对环境造成任何二次污染，而氯制剂会与水中的有机物反应生成多种氯代有机化合物，如三氯甲烷、氯仿等，这些物质均为公认的致癌突变物。娄人游泳时，这些有毒物质会被人体所吸收（在水中人体每水时呆吸收500毫升水）。水中的氯代有机化合物还会刺激人的眼睛及皮肤，从而引发红眼及皮疹。
从水中蒸发出来的氯代有机化合特以及氯气等有毒气体，聚集在泳池上方不易散去，损害人的呼吸器官，严重影响人们的身体健康，而使用臭氧则完全不会产生此种问题。加氯所产生的次氯酸及其衍生物，严重腐蚀水处理系统及镕内设备和结构如网架、暖气。
臭氧是最强的氧化剂，可有效分解水中的腐植质，氧化水中的铁、锰离子，分解水中散射光线的微小有机体，从而大大提高水的清澈度，使水呈现出美丽的蓝色，而氯制剂则无此效果。为合水呈蓝色，使用氯制剂的泳池，往往需加入硫酸铜盐，对人体及为有害。
加氯制剂后，必然会导制水PH值的改变，使人感到不适，因而需加入碱性或酸性物质中和，而臭氧的是中性物质，不会产生此种问题。臭氧能确保大客流量及高温季节时水质的稳定性，高温及客流量大时，水质往往不佳，此时，如果使用氯制剂，则需大量投加，这将带来一系列副作用，如PH值变化、对呼吸道及人体的刺激等，而大量投加臭氧则无此副作用。
